No duelo que colocou frente a frente as duas equipes que mais venceram no Campeonato Paulista de 2013, o São Paulo acabou derrotado para o Mogi Mirim, por 1x0, no estádio Romildão. Roger fez o único tento do jogo. Apesar do revés, os comandados do técnico Ney Franco encerraram a primeira fase do Estadual na 1ª colocação e, agora, medirão forças contra a Penapolense, nas quartas de final. O adversário do Sapão será o Botafogo-SP, que ficou com a sétima colocação. Passando, o Mogi encara o vencedor de Santos x Palmeiras.
Com a melhor campanha entre os 20 clubes que disputaram a primeira fase do Estadual, o São Paulo ganhou o direito de jogar no Morumbi na fase seguinte.
Na partida entre São Paulo e Penapolense da primeira fase, o Tricolor venceu por 2x0, com gols de Rhodolfo e Ademilson, no estádio Tenente Carriço.